Giovanni da Marcanova fu particolarmente legato al monastero di San Giovanni di Verdara. I suoi interessi verso le antichità classiche erano condivisi con i priori Timoteo Maffei, Matteo Bosso e Celso Maffei. La sua biblioteca confluì nella biblioteca del monastero. Il suo ritratto a fresco fa parte del ciclo "Uomini Illustri" presente sulle pareti della biblioteca. Inoltre particolarmente significativi furono i suoi rapporti con Andrea Mantegna e Felice Feliciano.